TCOG於1998年出版「大腸直腸癌診斷與治療之共識」，藉由共識手冊的內容，為患者及其家屬提供正確的指引使其有所參考；鑑於生物醫學科學不斷地進步，且各大醫院醫療團隊自行編訂大腸癌臨床診療指引，目前尚未有全國通行的臨床指引，因此國衛院邀集國內大腸直腸外科、腫瘤科、放射腫瘤科及病理科等大腸癌診療領域的專家組成編撰小組，著手撰寫大腸癌臨床診療指引。指引內容包括：大腸癌之篩檢與監測、遺傳性非瘜肉症大腸癌之篩檢、惡性瘜肉之臨床處置、原發性結腸癌之治療原則、結腸癌合併轉移之治療原則、早期直腸癌之局部治療原則、原發性直腸癌之治療原則、直腸癌合併轉移之治療原則、大腸癌腹腔鏡手術之原則、直腸癌術前合併化學及放射治療與術後化學及放射治療、大腸癌之化學治療、大腸癌手術後之追蹤、大腸癌之病理分期原則。